La présidente ou le président national est élu tous les trois ans par les délégué-e-s locaux au Congrès national du SEI.

La présidente ou le président national est secondé de près par deux dirigeantes ou dirigeants nationaux : les première et deuxième vice-présidentes ou premier et deuxième vice-présidents nationaux (VPN). La première vice-présidente ou le premier vice-président national se voit confier la responsabilité des finances, et la deuxième vice-présidente ou le deuxième vice-président national celle de la négociation collective.

Dix vice-présidentes et vice-présidents régionaux (VPR) servent de lien entre les sections locales du SEI et les dirigeantes et dirigeants nationaux.